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基于“五原则”结合蛛网模型辨析舒筋活血胶囊中的质量标志物(三) 基于网络药理学的研究方法

2025-05-14 09:22:59 来源:悦读馆   

咪唑类离子液体提取沙棘叶总黄酮的研究(一)

2.4基于舒筋活血胶囊成分的五原则可测性辨识潜在的Q-marker

依据可测性原则,查阅中国药典明确规定九味药材中6个定量成分的基于结合胶囊测定方法和限度要求,分别为羟基红花黄色素A(指标含量≥1.0%)、蛛网中的质量原儿茶酸(指标含量≥0.02%)、模型刺五加苷B(指标含量≥0.04%)、辨析标志4-甲氧基水杨醛(指标含量≥0.20%)、舒筋络石苷(指标含量≥0.45%)以及山奈素。活血α-香附酮、五原则豆甾醇、基于结合胶囊β-谷甾醇、蛛网中的质量木酚素、模型β-胡萝卜素和除虫菊素已有文献报道其含量测定的辨析标志方法。丁香脂素、舒筋高圣草素-7-O-β-D-芹菜糖基(1→2)-β-D-葡萄糖苷、活血杠柳苷A、五原则去甲络石苷和玉柏碱无文献明确报道其含量测定的方法。

2.5基于舒筋活血胶囊的有效性辨析潜在的Q-marker

Q-marker的核心要素是“有效”,因为对中药有效性的控制是质量控制的根本目的,基于网络药理学从“中药-成分-靶标-通路”网络图中发现与疾病相关的中药化学成分作为候选的质量标志物,是有效性的药效研究的关键思路。在临床上已经证明舒筋活血胶囊治疗骨质疏松症具有较好的临床疗效,因此,我们选择以骨质疏松症为疾病模型。


基于网络药理学的研究方法,探究舒筋活血胶囊治疗骨质疏松症发挥药效的化学成分及其作用的基因靶点与信号通路。在TCMSP数据库中逐一输入舒筋活血胶囊各单味药材名称,收集各味药材目前收录于该数据库的所有化学成分,根据其ADME(吸收、分布、代谢、排泄)OB≥30%,DL≥0.18,CACO-2≥0.4,BBB≥-0.3对化学成分的类药性进行评分,选出其中的活性成分。舒筋活血胶囊中总共筛选出16个活性化合物,见表2,其中红花8个活性化合物、香加皮3个活性化合物、络石藤3个活性化合物、伸筋草3个活性化合物、鸡血藤6个活性化合物、泽兰2个活性化合物、香附3个活性化合物,槲寄生3个活性化合物,狗脊中并无活性成分。

表2

判断中药复方有效性的指标是靶点的有无及作用的强弱,将收集的所有活性化合物输入到Genecards数据库,收集所有活性成分和疾病“Osteoporosis”靶点,筛选出每个化合物与疾病“Osteoporosis”的相同靶点。故在Uniprot数据库中,输入整理的相同靶点基因名称进行检索,得到基因的ID。将上述获得的基因的ID输入到DAVID数据库,进行KEGG通路富集分析,富集分析后将所得的结果设置成FDR<0.05、P<0.01作为显著性强的标准进行筛选,筛选出重要的信号通路并分析。

将上述活性成分、基因靶点、信号通路相互作用的数据整理成表格。整理药材和活性成分、活性成分与靶点、靶点与信号通路之间的相互关系。将上述数据联系导入Cytoscape软件中,得到“药材-化合物成分-基因靶点-信号通路”之间相互作用和关联的网络图(见图3)。

图3图3标

收集各化合物和疾病Osteoporosis的基因靶点,其中疾病Osteoporosis的靶点基因4078个,化合物与疾病相同基因靶点有184个。得到的相同的基因靶点ID输入到DAVID数据库中,舒筋活血胶囊中所有化合物涉及的184个靶点基因分析了83.9%通路,所作用的信号通路信息共135条,以FDR<0.05、P<0.01筛选出78条通路,选择前23条信号通路分析,其具体信息如表格3所示,舒筋活血胶囊里的有效成分通过这些通路来实现治疗骨质疏松症的目的。

如图3所示,从上至下依次为舒筋活血胶囊的单味药材、药材中发挥作用的活性成分、活性成分所作用的基因靶点、基因靶点所涉及的信号通路。该图直观的呈现出舒筋活血胶囊中“药材-化合物成分-基因靶点-靶点通路”之间的关系。

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